Protein–RNA interactions for Protein: Q692V3

Ttc41, Tetratricopeptide repeat protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 1,318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc41Q692V3 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ttc41Q692V3 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms