Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Atg9aQ68FE2 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Atg9aQ68FE2 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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Atg9aQ68FE2 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Atg9aQ68FE2 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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Atg9aQ68FE2 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Atg9aQ68FE2 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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Atg9aQ68FE2 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Atg9aQ68FE2 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Atg9aQ68FE2 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Atg9aQ68FE2 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Atg9aQ68FE2 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Atg9aQ68FE2 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Atg9aQ68FE2 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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Atg9aQ68FE2 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg9aQ68FE2 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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