Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Defa17Q64016 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
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Defa17Q64016 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
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Defa17Q64016 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Defa17Q64016 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms