Protein–RNA interactions for Protein: Q61282

Acan, Aggrecan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AcanQ61282 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
AcanQ61282 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
AcanQ61282 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
AcanQ61282 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
AcanQ61282 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
AcanQ61282 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
AcanQ61282 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
AcanQ61282 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
AcanQ61282 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms