Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Klf3Q60980 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Klf3Q60980 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms