Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms