Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 738.7 ms