Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sin3aQ60520 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sin3aQ60520 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sin3aQ60520 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sin3aQ60520 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sin3aQ60520 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sin3aQ60520 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sin3aQ60520 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sin3aQ60520 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sin3aQ60520 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sin3aQ60520 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sin3aQ60520 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sin3aQ60520 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sin3aQ60520 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sin3aQ60520 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sin3aQ60520 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sin3aQ60520 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sin3aQ60520 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sin3aQ60520 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sin3aQ60520 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sin3aQ60520 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sin3aQ60520 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sin3aQ60520 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sin3aQ60520 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sin3aQ60520 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sin3aQ60520 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sin3aQ60520 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sin3aQ60520 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sin3aQ60520 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sin3aQ60520 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sin3aQ60520 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sin3aQ60520 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sin3aQ60520 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sin3aQ60520 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sin3aQ60520 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sin3aQ60520 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sin3aQ60520 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sin3aQ60520 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sin3aQ60520 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sin3aQ60520 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sin3aQ60520 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sin3aQ60520 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sin3aQ60520 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sin3aQ60520 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sin3aQ60520 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sin3aQ60520 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sin3aQ60520 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sin3aQ60520 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sin3aQ60520 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sin3aQ60520 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sin3aQ60520 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sin3aQ60520 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sin3aQ60520 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sin3aQ60520 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sin3aQ60520 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sin3aQ60520 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sin3aQ60520 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sin3aQ60520 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sin3aQ60520 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sin3aQ60520 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sin3aQ60520 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sin3aQ60520 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sin3aQ60520 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sin3aQ60520 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sin3aQ60520 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sin3aQ60520 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sin3aQ60520 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sin3aQ60520 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sin3aQ60520 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sin3aQ60520 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sin3aQ60520 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sin3aQ60520 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sin3aQ60520 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sin3aQ60520 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sin3aQ60520 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sin3aQ60520 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sin3aQ60520 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sin3aQ60520 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sin3aQ60520 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sin3aQ60520 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sin3aQ60520 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sin3aQ60520 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sin3aQ60520 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sin3aQ60520 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sin3aQ60520 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sin3aQ60520 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sin3aQ60520 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sin3aQ60520 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sin3aQ60520 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sin3aQ60520 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sin3aQ60520 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sin3aQ60520 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sin3aQ60520 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sin3aQ60520 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sin3aQ60520 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sin3aQ60520 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sin3aQ60520 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sin3aQ60520 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sin3aQ60520 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sin3aQ60520 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms