Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim58Q5NCC9 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms