Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
D13Ertd608eQ3UPR8 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
D13Ertd608eQ3UPR8 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
D13Ertd608eQ3UPR8 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
D13Ertd608eQ3UPR8 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms