Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH1

Prrc1, Protein PRRC1, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc1Q3UPH1 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
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Prrc1Q3UPH1 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Prrc1Q3UPH1 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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