Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Tmem253Q3UNB8 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Tmem253Q3UNB8 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Tmem253Q3UNB8 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Tmem253Q3UNB8 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
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Tmem253Q3UNB8 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Tmem253Q3UNB8 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Tmem253Q3UNB8 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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