Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Arfgef3Q3UGY8 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms