Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hace1Q3U0D9 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hace1Q3U0D9 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms