Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nlrp1aQ2LKU9 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms