Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Trim71Q1PSW8 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
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