Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptcd3Q14C51 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms