Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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ptchd1Q14B62 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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ptchd1Q14B62 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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ptchd1Q14B62 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
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ptchd1Q14B62 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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ptchd1Q14B62 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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ptchd1Q14B62 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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ptchd1Q14B62 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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ptchd1Q14B62 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
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ptchd1Q14B62 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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ptchd1Q14B62 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ptchd1Q14B62 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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