Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Ttc39dQ0VF76 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Ttc39dQ0VF76 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Ttc39dQ0VF76 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Ttc39dQ0VF76 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Ttc39dQ0VF76 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Ttc39dQ0VF76 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Ttc39dQ0VF76 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Ttc39dQ0VF76 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Ttc39dQ0VF76 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Ttc39dQ0VF76 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Ttc39dQ0VF76 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Ttc39dQ0VF76 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Ttc39dQ0VF76 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttc39dQ0VF76 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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