Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf541Q0GGX2 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms