Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Col9a2Q07643 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms