Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms