Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prrx2Q06348 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms