Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms