Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HmgcrQ01237 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
HmgcrQ01237 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HmgcrQ01237 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
HmgcrQ01237 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
HmgcrQ01237 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HmgcrQ01237 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HmgcrQ01237 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HmgcrQ01237 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
HmgcrQ01237 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
HmgcrQ01237 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HmgcrQ01237 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
HmgcrQ01237 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HmgcrQ01237 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HmgcrQ01237 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HmgcrQ01237 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HmgcrQ01237 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
HmgcrQ01237 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
HmgcrQ01237 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
HmgcrQ01237 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
HmgcrQ01237 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
HmgcrQ01237 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
HmgcrQ01237 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
HmgcrQ01237 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
HmgcrQ01237 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
HmgcrQ01237 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
HmgcrQ01237 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms