Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms