Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pde1bQ01065 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.8 ms