Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
PrcdQ00LT2 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC8.82□□□□□ -1
PrcdQ00LT2 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms