Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Pax8Q00288 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Pax8Q00288 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms