Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
GferP56213 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
GferP56213 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
GferP56213 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
GferP56213 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
GferP56213 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
GferP56213 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
GferP56213 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
GferP56213 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
GferP56213 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
GferP56213 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
GferP56213 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
GferP56213 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
GferP56213 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
GferP56213 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
GferP56213 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
GferP56213 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
GferP56213 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
GferP56213 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
GferP56213 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
GferP56213 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
GferP56213 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
GferP56213 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
GferP56213 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
GferP56213 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
GferP56213 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
GferP56213 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
GferP56213 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
GferP56213 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
GferP56213 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
GferP56213 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
GferP56213 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
GferP56213 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
GferP56213 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
GferP56213 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
GferP56213 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
GferP56213 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
GferP56213 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
GferP56213 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
GferP56213 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
GferP56213 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
GferP56213 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
GferP56213 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
GferP56213 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
GferP56213 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
GferP56213 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
GferP56213 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
GferP56213 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
GferP56213 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
GferP56213 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
GferP56213 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
GferP56213 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
GferP56213 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
GferP56213 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
GferP56213 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
GferP56213 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
GferP56213 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
GferP56213 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
GferP56213 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GferP56213 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GferP56213 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
GferP56213 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GferP56213 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
GferP56213 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
GferP56213 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GferP56213 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GferP56213 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GferP56213 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GferP56213 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
GferP56213 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
GferP56213 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GferP56213 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GferP56213 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GferP56213 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
GferP56213 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GferP56213 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
GferP56213 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GferP56213 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
GferP56213 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
GferP56213 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GferP56213 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
GferP56213 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
GferP56213 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
GferP56213 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
GferP56213 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GferP56213 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GferP56213 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GferP56213 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GferP56213 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
GferP56213 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
GferP56213 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GferP56213 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GferP56213 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GferP56213 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GferP56213 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GferP56213 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GferP56213 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GferP56213 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
GferP56213 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
GferP56213 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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