Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Opn1swP51491 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Opn1swP51491 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Opn1swP51491 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Opn1swP51491 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Opn1swP51491 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Opn1swP51491 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Opn1swP51491 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Opn1swP51491 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Opn1swP51491 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Opn1swP51491 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms