Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TspoP50637 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TspoP50637 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TspoP50637 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TspoP50637 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TspoP50637 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TspoP50637 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TspoP50637 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TspoP50637 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TspoP50637 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TspoP50637 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TspoP50637 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TspoP50637 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TspoP50637 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TspoP50637 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TspoP50637 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TspoP50637 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TspoP50637 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TspoP50637 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TspoP50637 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TspoP50637 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TspoP50637 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TspoP50637 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TspoP50637 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TspoP50637 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TspoP50637 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TspoP50637 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TspoP50637 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TspoP50637 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TspoP50637 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TspoP50637 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TspoP50637 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TspoP50637 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TspoP50637 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TspoP50637 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TspoP50637 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TspoP50637 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TspoP50637 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TspoP50637 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TspoP50637 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TspoP50637 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TspoP50637 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TspoP50637 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TspoP50637 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TspoP50637 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TspoP50637 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TspoP50637 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TspoP50637 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TspoP50637 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TspoP50637 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TspoP50637 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TspoP50637 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TspoP50637 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TspoP50637 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TspoP50637 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TspoP50637 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TspoP50637 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TspoP50637 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TspoP50637 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TspoP50637 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TspoP50637 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TspoP50637 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TspoP50637 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TspoP50637 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TspoP50637 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TspoP50637 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TspoP50637 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TspoP50637 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
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TspoP50637 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TspoP50637 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
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TspoP50637 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TspoP50637 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TspoP50637 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TspoP50637 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TspoP50637 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TspoP50637 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TspoP50637 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TspoP50637 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TspoP50637 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TspoP50637 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TspoP50637 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TspoP50637 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TspoP50637 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TspoP50637 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TspoP50637 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TspoP50637 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TspoP50637 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TspoP50637 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TspoP50637 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TspoP50637 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TspoP50637 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TspoP50637 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TspoP50637 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TspoP50637 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TspoP50637 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TspoP50637 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TspoP50637 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TspoP50637 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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