Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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PtgfrP43117 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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PtgfrP43117 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
PtgfrP43117 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
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PtgfrP43117 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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PtgfrP43117 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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PtgfrP43117 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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PtgfrP43117 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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PtgfrP43117 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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PtgfrP43117 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
PtgfrP43117 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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