Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Rpl28P41105 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms