Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ThpoP40226 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ThpoP40226 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ThpoP40226 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ThpoP40226 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ThpoP40226 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ThpoP40226 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ThpoP40226 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ThpoP40226 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ThpoP40226 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ThpoP40226 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ThpoP40226 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ThpoP40226 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ThpoP40226 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ThpoP40226 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ThpoP40226 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms