Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PpardP35396 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PpardP35396 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PpardP35396 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PpardP35396 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PpardP35396 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PpardP35396 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PpardP35396 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
PpardP35396 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpardP35396 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpardP35396 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpardP35396 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpardP35396 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpardP35396 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpardP35396 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpardP35396 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpardP35396 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpardP35396 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpardP35396 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpardP35396 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpardP35396 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PpardP35396 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpardP35396 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpardP35396 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpardP35396 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpardP35396 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpardP35396 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpardP35396 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpardP35396 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpardP35396 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpardP35396 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpardP35396 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpardP35396 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PpardP35396 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpardP35396 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PpardP35396 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpardP35396 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PpardP35396 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpardP35396 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpardP35396 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpardP35396 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpardP35396 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpardP35396 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpardP35396 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpardP35396 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpardP35396 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpardP35396 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpardP35396 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpardP35396 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpardP35396 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpardP35396 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpardP35396 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PpardP35396 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpardP35396 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PpardP35396 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PpardP35396 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PpardP35396 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PpardP35396 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PpardP35396 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PpardP35396 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PpardP35396 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PpardP35396 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PpardP35396 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PpardP35396 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PpardP35396 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PpardP35396 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PpardP35396 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PpardP35396 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PpardP35396 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PpardP35396 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PpardP35396 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PpardP35396 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PpardP35396 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PpardP35396 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PpardP35396 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PpardP35396 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PpardP35396 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PpardP35396 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
PpardP35396 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PpardP35396 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PpardP35396 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PpardP35396 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PpardP35396 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PpardP35396 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PpardP35396 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PpardP35396 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PpardP35396 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PpardP35396 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PpardP35396 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PpardP35396 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PpardP35396 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PpardP35396 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PpardP35396 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
PpardP35396 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
PpardP35396 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PpardP35396 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PpardP35396 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
PpardP35396 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
PpardP35396 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
PpardP35396 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms