Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NapbP28663 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NapbP28663 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NapbP28663 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NapbP28663 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NapbP28663 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NapbP28663 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NapbP28663 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NapbP28663 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NapbP28663 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NapbP28663 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
NapbP28663 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NapbP28663 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
NapbP28663 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NapbP28663 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NapbP28663 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NapbP28663 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NapbP28663 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NapbP28663 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NapbP28663 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NapbP28663 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NapbP28663 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NapbP28663 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
NapbP28663 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NapbP28663 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NapbP28663 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NapbP28663 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NapbP28663 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NapbP28663 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NapbP28663 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
NapbP28663 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NapbP28663 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NapbP28663 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NapbP28663 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
NapbP28663 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NapbP28663 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NapbP28663 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NapbP28663 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NapbP28663 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NapbP28663 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NapbP28663 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NapbP28663 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
NapbP28663 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NapbP28663 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NapbP28663 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NapbP28663 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NapbP28663 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NapbP28663 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NapbP28663 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NapbP28663 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NapbP28663 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NapbP28663 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NapbP28663 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NapbP28663 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NapbP28663 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NapbP28663 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NapbP28663 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NapbP28663 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NapbP28663 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NapbP28663 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NapbP28663 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NapbP28663 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NapbP28663 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NapbP28663 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NapbP28663 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NapbP28663 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NapbP28663 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NapbP28663 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NapbP28663 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NapbP28663 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NapbP28663 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NapbP28663 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NapbP28663 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NapbP28663 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NapbP28663 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NapbP28663 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NapbP28663 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NapbP28663 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NapbP28663 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NapbP28663 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NapbP28663 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NapbP28663 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NapbP28663 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NapbP28663 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NapbP28663 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NapbP28663 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NapbP28663 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NapbP28663 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NapbP28663 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NapbP28663 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NapbP28663 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NapbP28663 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NapbP28663 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NapbP28663 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NapbP28663 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NapbP28663 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NapbP28663 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NapbP28663 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NapbP28663 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NapbP28663 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms