Protein–RNA interactions for Protein: P28661

Sept4, Septin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept4P28661 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept4P28661 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept4P28661 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept4P28661 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept4P28661 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept4P28661 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept4P28661 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept4P28661 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept4P28661 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept4P28661 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept4P28661 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept4P28661 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept4P28661 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept4P28661 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept4P28661 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept4P28661 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept4P28661 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept4P28661 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept4P28661 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept4P28661 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept4P28661 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept4P28661 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept4P28661 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept4P28661 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept4P28661 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept4P28661 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept4P28661 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept4P28661 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sept4P28661 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sept4P28661 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sept4P28661 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sept4P28661 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sept4P28661 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Sept4P28661 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sept4P28661 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Sept4P28661 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sept4P28661 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sept4P28661 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept4P28661 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept4P28661 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept4P28661 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept4P28661 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept4P28661 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept4P28661 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept4P28661 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept4P28661 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept4P28661 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept4P28661 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept4P28661 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept4P28661 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept4P28661 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept4P28661 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept4P28661 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept4P28661 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept4P28661 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept4P28661 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept4P28661 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept4P28661 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept4P28661 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept4P28661 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept4P28661 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept4P28661 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept4P28661 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept4P28661 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept4P28661 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept4P28661 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept4P28661 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept4P28661 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept4P28661 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept4P28661 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept4P28661 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept4P28661 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sept4P28661 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sept4P28661 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sept4P28661 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sept4P28661 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sept4P28661 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sept4P28661 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sept4P28661 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sept4P28661 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sept4P28661 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sept4P28661 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sept4P28661 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sept4P28661 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sept4P28661 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sept4P28661 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sept4P28661 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sept4P28661 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sept4P28661 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sept4P28661 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sept4P28661 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sept4P28661 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sept4P28661 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sept4P28661 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sept4P28661 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sept4P28661 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sept4P28661 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sept4P28661 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sept4P28661 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sept4P28661 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms