Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Psmb9P28076 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb9P28076 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms