Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChgaP26339 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChgaP26339 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ChgaP26339 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ChgaP26339 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChgaP26339 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChgaP26339 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChgaP26339 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChgaP26339 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChgaP26339 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChgaP26339 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Bud31-206ENSMUST00000162308 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChgaP26339 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChgaP26339 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChgaP26339 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms