Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PrkcaP20444 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms