Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Vpreb2P13373 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms