Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hoxd4P10628 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms