Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

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Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
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PdgfrbP05622 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PdgfrbP05622 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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