Protein–RNA interactions for Protein: P04941

Ig kappa chain V-VI region NQ2-48.2.2, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04941 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04941 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04941 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P04941 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04941 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04941 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04941 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04941 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04941 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04941 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04941 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04941 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04941 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04941 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04941 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04941 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04941 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04941 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04941 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P04941 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P04941 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P04941 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04941 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P04941 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P04941 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04941 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P04941 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P04941 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04941 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04941 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04941 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04941 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04941 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04941 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04941 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04941 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04941 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04941 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04941 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04941 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P04941 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P04941 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P04941 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P04941 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P04941 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P04941 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P04941 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P04941 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P04941 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P04941 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04941 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04941 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04941 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04941 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P04941 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04941 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04941 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P04941 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04941 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04941 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04941 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04941 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04941 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04941 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04941 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04941 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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P04941 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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P04941 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04941 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04941 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04941 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04941 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04941 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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P04941 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P04941 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04941 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04941 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04941 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04941 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04941 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04941 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04941 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04941 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04941 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04941 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04941 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P04941 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04941 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04941 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04941 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04941 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04941 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04941 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P04941 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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