Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cfdp1O88271 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms