Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FxnO35943 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FxnO35943 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FxnO35943 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FxnO35943 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FxnO35943 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FxnO35943 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FxnO35943 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FxnO35943 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FxnO35943 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FxnO35943 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FxnO35943 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FxnO35943 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FxnO35943 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FxnO35943 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FxnO35943 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FxnO35943 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FxnO35943 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
FxnO35943 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FxnO35943 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FxnO35943 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FxnO35943 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FxnO35943 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
FxnO35943 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FxnO35943 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
FxnO35943 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
FxnO35943 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FxnO35943 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FxnO35943 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FxnO35943 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
FxnO35943 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FxnO35943 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FxnO35943 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FxnO35943 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FxnO35943 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FxnO35943 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FxnO35943 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FxnO35943 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FxnO35943 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FxnO35943 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FxnO35943 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FxnO35943 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FxnO35943 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FxnO35943 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FxnO35943 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FxnO35943 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FxnO35943 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FxnO35943 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FxnO35943 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FxnO35943 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
FxnO35943 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FxnO35943 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FxnO35943 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
FxnO35943 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FxnO35943 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FxnO35943 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FxnO35943 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
FxnO35943 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FxnO35943 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FxnO35943 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FxnO35943 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FxnO35943 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
FxnO35943 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FxnO35943 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FxnO35943 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FxnO35943 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FxnO35943 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FxnO35943 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FxnO35943 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FxnO35943 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FxnO35943 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FxnO35943 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FxnO35943 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FxnO35943 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FxnO35943 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FxnO35943 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
FxnO35943 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
FxnO35943 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
FxnO35943 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
FxnO35943 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
FxnO35943 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
FxnO35943 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
FxnO35943 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
FxnO35943 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
FxnO35943 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
FxnO35943 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
FxnO35943 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
FxnO35943 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
FxnO35943 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
FxnO35943 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
FxnO35943 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
FxnO35943 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
FxnO35943 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
FxnO35943 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
FxnO35943 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
FxnO35943 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FxnO35943 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FxnO35943 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
FxnO35943 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FxnO35943 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms