Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gm5046-201ENSMUST00000100608 611 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Nppb-201ENSMUST00000103231 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gm13084-202ENSMUST00000105769 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Cbx3-ps3-201ENSMUST00000118595 550 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Olfr1081-ps1-201ENSMUST00000120210 945 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gm12998-201ENSMUST00000122445 789 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gm45636-201ENSMUST00000210497 1064 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Olfr724-201ENSMUST00000075030 1006 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Akap7-202ENSMUST00000095779 919 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
ColqO35348 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ColqO35348 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ColqO35348 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ColqO35348 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ColqO35348 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ColqO35348 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ColqO35348 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ColqO35348 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ColqO35348 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ColqO35348 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ColqO35348 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ColqO35348 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ColqO35348 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ColqO35348 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gm14253-201ENSMUST00000122112 639 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ColqO35348 Tsc22d3-204ENSMUST00000123898 952 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ColqO35348 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gm25971-201ENSMUST00000158953 286 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ColqO35348 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ColqO35348 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ColqO35348 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gm37724-201ENSMUST00000195240 1221 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ColqO35348 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ColqO35348 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ColqO35348 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ColqO35348 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gm45625-201ENSMUST00000209412 650 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ColqO35348 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gm34165-201ENSMUST00000222012 1174 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ColqO35348 AC162934.3-201ENSMUST00000223015 841 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ColqO35348 AC134254.4-201ENSMUST00000223086 370 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ColqO35348 AC153646.1-201ENSMUST00000223229 1279 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ColqO35348 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ColqO35348 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ColqO35348 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ColqO35348 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ColqO35348 Defb10-201ENSMUST00000054162 298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ColqO35348 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
ColqO35348 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
ColqO35348 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
ColqO35348 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms