Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
MttpO08601 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MttpO08601 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
MttpO08601 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MttpO08601 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MttpO08601 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MttpO08601 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MttpO08601 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
MttpO08601 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MttpO08601 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MttpO08601 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MttpO08601 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MttpO08601 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MttpO08601 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MttpO08601 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MttpO08601 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MttpO08601 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MttpO08601 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MttpO08601 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MttpO08601 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MttpO08601 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MttpO08601 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MttpO08601 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MttpO08601 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MttpO08601 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MttpO08601 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MttpO08601 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MttpO08601 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MttpO08601 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MttpO08601 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MttpO08601 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MttpO08601 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MttpO08601 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MttpO08601 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MttpO08601 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MttpO08601 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MttpO08601 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MttpO08601 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MttpO08601 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MttpO08601 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MttpO08601 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MttpO08601 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MttpO08601 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MttpO08601 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MttpO08601 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MttpO08601 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MttpO08601 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MttpO08601 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
MttpO08601 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
MttpO08601 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MttpO08601 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MttpO08601 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
MttpO08601 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MttpO08601 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
MttpO08601 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MttpO08601 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MttpO08601 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MttpO08601 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MttpO08601 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MttpO08601 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
MttpO08601 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MttpO08601 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MttpO08601 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MttpO08601 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MttpO08601 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MttpO08601 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
MttpO08601 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
MttpO08601 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
MttpO08601 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MttpO08601 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MttpO08601 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MttpO08601 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MttpO08601 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MttpO08601 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MttpO08601 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MttpO08601 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MttpO08601 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MttpO08601 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MttpO08601 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MttpO08601 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MttpO08601 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MttpO08601 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MttpO08601 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
MttpO08601 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MttpO08601 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MttpO08601 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MttpO08601 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MttpO08601 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
MttpO08601 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
MttpO08601 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
MttpO08601 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
MttpO08601 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
MttpO08601 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MttpO08601 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
MttpO08601 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MttpO08601 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
MttpO08601 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
MttpO08601 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MttpO08601 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
MttpO08601 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms