Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20878L7N244 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20878L7N244 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms